Les superbes collections d'égyptologie ont réintégré le Neues Museum, entièrement rénové. Les pièces datant de l’époque du pharaon Akhénaton, découvertes à Tell-el-Amarna, constituent le fleuron de la collection égyptienne : deux reliefs d’Aménophis III, le père d’Akhénaton, coiffé du diadème et de la couronne ; portrait de la reine Tiyi (vers 1355 av. J.-C.), sculpté dans du bois d’if, d’un grand réalisme ; portraits et reliefs de la famille royale d’Akhénaton (Akhénaton lui-même, Néfertiti, Toutankhamon…), de ce style « impressionniste » si caractéristique ; et célèbre buste de la reine Néfertiti, épouse d’Akhénaton, découvert en 1912.